Summary
of the results of several recent detailed analyses |
|
|
|
|
|
of the N-terminal portion of HAdV-5 E1A |
|
|
|
Table 1: E1A N-terminal amino acid
requirements for protein interactions, |
|
transcriptional repression and interference with TBP-TATA
complex formation |
|
|
|
Mutant polypeptide |
CBP/p300 binding in vitro |
TBP binding in vitro |
In vitro repression of HIV LTR |
In vivo repression of HIV LTR |
TBP-TATA disruption |
Reference |
|
E1A 1–80 wt |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 R2A |
+++ |
+++ |
+ |
++ |
++ |
1 |
|
E1A 1–80 H3A |
+++ |
+++ |
− |
+ |
± |
1 |
|
E1A 1–80 I4A |
+++ |
+++ |
− |
± |
− |
1 |
|
E1A 1–80 I5A |
+++ |
+++ |
− |
± |
− |
1 |
|
E1A 1–80 C6A |
− |
− |
− |
− |
− |
1 |
|
E1A 1–80 H7A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 G8A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 G9A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 V10A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 I11A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 T12A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 E13A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 E14A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 M15A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 S18A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 L19A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 L20A |
+++ |
+++ |
− |
± |
− |
1 |
|
E1A 1–80 D21A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 Q22A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 L23A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 I24A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 E25A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 E26A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 V27A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 L28A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 D30A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 D48A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 L49A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 D50A |
++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 V51A |
++ |
+++ |
+++ |
++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 T52A |
++ |
+++ |
+++ |
++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 A53G |
± |
+++ |
+ |
− |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 P54A |
± |
+++ |
± |
− |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 E55A |
± |
+++ |
± |
− |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 D56A |
± |
++ |
± |
± |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 P57A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 N58A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 E59A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 E60A |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
1 |
|
|
|
|
E1A 1–80 Δ4–25 |
− |
− |
− |
− |
+++ |
1 |
|
E1A 1–80 Δ2-5 |
+++ |
+++ |
− |
− |
− |
2 |
|
E1A 1–80 Δ6-10 |
− |
− |
− |
− |
− |
2 |
|
E1A 1–80 Δ11-15 |
+++ |
+++ |
++ |
+++ |
++++ |
2 |
|
E1A 1–80 Δ16-20 |
+++ |
+++ |
− |
− |
− |
2 |
|
E1A 1–80 Δ26-30 |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
+++ |
2 |
|
E1A 1–80 Δ48–60 |
− |
++ |
− |
− |
+++ |
1 |
|
|
Table 2: E1A N-terminal amino acid
requirements for various |
|
protein interactions and transformation with ras |
|
|
Mutant |
CBP/p300 binding in vitro |
CBP/p300 binding in vivo |
TBP binding in vitro |
TBP binding in vivo |
S4/S8 binding in vitro |
S8 binding in vivo |
pCAF binding in vitro |
hGCN5 binding in vitro |
Ran binding in vitro |
pRb binding in vivo |
Relative Transformation(%) |
Reference |
12S wt |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
100 |
3 |
12S R2G |
+++ |
– |
++ |
+ |
++++ |
++ |
+++ |
+++ |
++++ |
++++ |
11.5 |
3 |
12S I5G |
+++/++ |
– |
++ |
++++ |
++ |
++ |
− |
+ |
++ |
++++ |
4.5 |
3 |
12S C6A |
+ |
++ |
++ |
+ |
+ |
+++ |
+ |
++ |
++ |
++++ |
40 |
3 |
12S H7A |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
+++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
98.7 |
3 |
12S G8A |
++++ |
ND |
++++ |
ND |
++++ |
ND |
++++ |
++++ |
++++ |
ND |
80.4 |
3 |
12S V10A |
++ |
ND |
+++ |
ND |
+++ |
ND |
+ |
++ |
++++ |
ND |
83 |
3 |
12S I11A |
+ |
+++ |
+ |
++ |
+ |
+++ |
− |
− |
++++ |
++++ |
35.5 |
3 |
12S T12A |
++++/++ |
+++ |
++ |
++ |
++ |
+ |
+ |
+ |
++ |
++++ |
56 |
3 |
12S E14A |
++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
++++ |
+++ |
++ |
++++ |
70.5 |
3 |
12S A16G |
+ |
ND |
++++ |
ND |
+++ |
ND |
− |
+ |
+++ |
ND |
30.9 |
3 |
12S S18G |
++ |
+++ |
++++ |
+++ |
+++ |
+++ |
++ |
++ |
+++ |
++++ |
112 |
3 |
12S L19A |
+ |
+ |
+ |
++ |
+ |
+ |
− |
− |
+ |
++++ |
38 |
3 |
12S L1920A |
− |
– |
− |
– |
− |
– |
− |
− |
− |
++++ |
15 |
3 |
12S L20A |
−/+ |
+ |
+ |
– |
− |
– |
− |
− |
+ |
++++ |
46 |
3 |
12S D21A |
+++ |
ND |
++++ |
ND |
++++ |
ND |
++++ |
++++ |
+ |
ND |
57 |
3 |
12S L23A |
− |
+ |
+ |
– |
+ |
– |
− |
− |
+ |
++++ |
38 |
3 |
12S I24A |
− |
+++ |
+ |
+ |
+ |
++++ |
− |
− |
+ |
++++ |
37.6 |
3 |
12S E25A |
++++ |
ND |
++ |
ND |
+++ |
ND |
++++ |
+++ |
++ |
ND |
112 |
3 |
12S E26A |
++ |
ND |
++++ |
ND |
+++ |
ND |
++++ |
++ |
+ |
ND |
121 |
3 |
12S V27A |
+++ |
++++ |
++++ |
++++ |
+++ |
+++ |
+ |
+++ |
+++ |
++++ |
74.7 |
3 |
12S L28A |
− |
++ |
+++ |
++++ |
− |
– |
− |
− |
++ |
++++ |
45 |
3 |
12S A29G |
++++/++ |
ND |
++++ |
ND |
++++ |
ND |
++++ |
+++ |
++++ |
ND |
97 |
3 |
12S D30A |
++++ |
++++ |
++++ |
++ |
+ |
+ |
++++ |
++ |
++ |
++++ |
43.5 |
3 |
|
References: |
|
1)
Loewenstein PM, Arackal S, Green M. Virology. 2006 May 5; [Epub ahead of
print] |
|
2)
Boyd JM, Loewenstein PM, Tang Qq QQ, Yu L, Green M. J Virol. 2002
76:1461-74. |
|
3) Rasti
M, Grand RJ, Mymryk JS, Gallimore PH, Turnell AS. J Virol. 2005
79:5594-605. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|